Bulletin des agents pathogènes des voies respiratoires émergents: Numéro 86, février 2024

Le bulletin APRE (Agents pathogènes humains des voies respiratoires émergents) est une publication mensuelle élaborée par le Centre des infections émergentes et respiratoires et de la préparation aux pandémies (CIERPP) de l'Agence de la santé publique du Canada (ASPC). Le bulletin APRE est un mécanisme d'information sur les indicateurs de surveillance des événements actifs de santé publique à l'échelle mondiale touchant les humains en matière d'agents pathogènes des voies respiratoires émergents. Il s'agit d'agents pathogènes tels que les nouvelles grippes (d'origine aviaire et porcine), le Coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (SRMO-CoV) et d'autres agents pathogènes respiratoires émergents ponctuels.

Faits saillant du mois

Au cours du mois de février 2024, les cas humains suivants ont été signalés :

• Trois nouveaux cas humains de grippe aviaire A(H5N1)
• Un nouveau cas humain de grippe aviaire A(H9N2)
• Deux nouveaux cas humains de grippe A(H1N1)v d'origine porcine
• Un nouveau cas humain de SRMO-CoV

Figure 1 - Équivalent textuel

• Trois cas d'A(H5N1) ont été signalés au Cambodge.
• Un cas d'A(H9N2) a été signalé en Chine.
• Deux cas d' A(H1N1)v ont été signalé en Brésil et Espagne.

Mises à jour sur les virus grippaux aviaires

Grippe aviaire A(H5N1)

Trois nouveaux cas humains de grippe aviaire A(H5N1) ont été signales en février 2024 au Cambodge.

Le premier cas était un garçon de 9 ans du village Kapo 1, commune d'Or Russey, ville de Kratie, province de Kratie, Cambodge. Le cas présentait des symptômes de fièvre, d'essoufflement, de toux et de perte de connaissance le 31 janvier 2024. Il a été hospitalisé le 5 février 2024 et est décédé le 8 février 2024. Le deuxième cas était un homme de 16 ans, identifié le 11 février 2024 comme un contact étroit du garçon de 9 ans, le premier cas. Le cas était asymptomatique, mais il a été hospitalisé pour suivi et traitement et il était isolé à la maison au moment du dernier rapport.

Le premier (garçon de 9 ans) et le deuxième (garçon de 16 ans) cas sont des frères ; de la volaille morte a été apportée du ménage du premier cas au ménage du deuxième cas, et les deux frères ont été exposés. Le poulet a été cuit et consommé par les deux frères. D'après les renseignements disponibles, la contamination interhumaine ne peut être exclue ; cependant, aucun autre cas soupçonné ou preuve de contamination interhumaine certaine n'a été trouvé.

Le troisième cas était une jeune fille de 17 ans qui résidait dans la province de Kampot, au Cambodge. Elle a développé de la fièvre, de la toux, de la fatigue et des difficultés respiratoires à une date non rapportée. Selon le dernier rapport, elle était aux soins intensifs. On a signalé une exposition à 7 poulets morts environ 5 jours avant l'apparition de la maladie.

En 2024, on a détecté 5 cas humains de grippe aviaire A (H5N1) dans le monde. Depuis 2022, 21 cas humains d'A(H5N1) ont été signalés dans le monde (2022 : n = 6, 2023 : n = 13, 2024 : n = 5) au Cambodge (11), au Chili (1), en Chine (2), en Équateur (1), en Espagne (2), au Royaume-Uni (5), aux États-Unis (1), au Vietnam (1) (Figure 2). Parmi ces cas, 13 (dont un décès) appartenaient au clade 2.3.4.4b et neuf, tous situés au Cambodge (dont quatre décès) appartenaient au clade 2.3.2.1c, et deux sont en attente. Le clade A (H5N1) 2.3.2.1c détecté au Cambodge est différent du clade A (H5N1) 2.3.4.4b qui circule principalement dans le monde entier, y compris au Canada. Depuis l'émergence du virus A (H5N1) chez l'homme en 1997, 905 cas humains de virus A (H5N1) ont été signalés dans le monde, avec un taux de létalité de 52 % (Figure 3).

Un nombre important de détections d'A(H5N1) associées à l'épizootie actuelle 2021-2024 d'A(H5N1) du clade 2.3.4.4b a été signalé dans des populations d'oiseaux domestiques, de jardin et sauvages, ainsi que dans d'autres espèces animales à travers le Canada. Aucune infection humaine par le virus A(H5N1) acquise localement n'a jamais été signalée au Canada. En 2014, le Canada (Alberta) a signalé un seul cas mortel lié au virus A(H5N1) chez un résident revenant d'un voyage en Chine.

Figure 2 - Équivalent textuel

• Onze (11) cas ont été signalés au Cambodge.
• Cinq (5) cas ont été signalés au Royaume-Uni.
• Deux (2) cas ont été signalés en Chine.
• Deux (2) cas ont été signalés en Espagne.
• Un (1) cas a été signalé au Chili.
• Un (1) cas a été signalé en Équateur.
• Un (1) cas a été signalé aux États-Unis d'Amérique.
• Un (1) cas a été signalé au Vietnam.

Figure 3 - Équivalent textuel

Distribution temporelle des cas humains de grippe A(H5N1) signalés dans le monde, par année, du 1er janvier 1997 au 29 février 2024 (n=905).

Année	Nombre de cas	Décès	Survivant
1997	18	6	12
1998	0	0	0
1999	0	0	0
2000	0	0	0
2001	0	0	0
2002	0	0	0
2003	4	4	0
2004	46	32	14
2005	98	43	55
2006	115	79	36
2007	88	59	29
2008	44	33	11
2009	73	32	41
2010	48	24	24
2011	62	34	28
2012	32	20	12
2013	39	25	14
2014	52	22	30
2015	145	42	103
2016	10	3	7
2017	4	2	2
2018	0	0	0
2019	1	1	0
2020	1	0	1
2021	2	1	1
2022	5	1	4
2023	13	4	9
2024	5	1	4

Grippe aviaire A(H5N6)

Le cas humain le plus récent d' grippe aviaire A (H5N6) a été signalé en janvier 2024 en Chine.

En 2024, on a détecté un cas humain de grippe aviaire A (H5N6) dans le monde. En 2023, six cas humains de grippe aviaire A (H5N6) ont été détectés, tous en Chine. Depuis janvier 2021, 64 cas d'influenza aviaire A(H5N6) ont été signalés dans le monde (Figure 3); 63 cas d'A(H5N6) ont été signalés en Chine et un cas a été signalé à la République démocratique populaire du Laos (Figure 4). Depuis l'apparition de ce virus en 2014, un total de 90 cas humains confirmés en laboratoire de grippe aviaire A(H5N6), dont au moins 35 décès, ont été signalés à l'échelle mondiale (taux de létalité : 39 %). Aucun cas n'a été signalé au Canada.

Figure 4 - Équivalent textuel

Distribution temporelle des cas humains de grippe A(H5N6) signalés dans le monde, par mois, du 1er janvier 2021 au 29 février 2024 (n=64).

Année	Mois	Cas
2021	Janv	1
	Févr	2
	Mars	2
	Avr	0
	Mai	0
	Juin	1
	Juillet	4
	Août	6
	Sept	6
	Oct	4
	Nov	0
	Déc	6
2022	Janv	8
	Févr	6
	Mars	3
	Avr	3
	Mai	1
	Juin	1
	Juillet	0
	Août	0
	Sept	1
	Oct	1
	Nov	0
	Déc	1
2023	Janv	0
	Févr	0
	Mars	1
	Avr	0
	Mai	1
	Juin	0
	Juillet	1
	Août	2
	Sept	0
	Oct	0
	Nov	0
	Déc	1
2024	Janv	1
	Févr	0

Grippe aviaire A(H9N2)

Un nouveau cas humain d'influenza aviaire A (H9N2) a été signalés en février 2024 en Chine.

Le cas était celui d'une petite fille de 22 mois qui a développé des symptômes de fièvre et de toux avec expectorations le 15 février 2024 et qui s'est rendue dans un établissement médical le lendemain sans avoir à être hospitalisée. L'infection au A (H9N2) a été confirmée le 23 février 2024 et le virus a été jugé sensible à l'antiviral Tamiflu. Le cas s'est rétabli depuis. Le cas s'est rendu à Zhongshan, dans la province du Guangdong, pendant la période d'incubation. Elle n'avait pas déclaré avoir eu de contact direct avec de la volaille récemment, n'avait pas consommé de volaille insuffisamment cuite et n'avait eu aucun contact avec des patients.

Un contact familial a eu mal à la gorge le 17 février 2024, bien que ce symptôme se soit atténué après la prise de médicaments et que le test de dépistage de la grippe A ait été négatif. Les autres contacts familiaux du cas étaient asymptomatiques.

Il s'agit du premier cas d'influenza aviaire A (H9N2) signalé chez l'être humain en 2024. En 2023, 15 cas humains de grippe aviaire A(H9N2) ont été détectés, tous en Chine. Depuis l'émergence de ce virus dans la population humaine en 1998, 123 cas ont été signalés dans le monde, avec un taux de létalité de 2 %. Aucun cas n'a été signalé au Canada.

Mises à jour sur les virus grippaux d'origine porcine

Grippe A(H1N1)v d'origine porcine

Deux nouveau cas humains de grippe A(H1N1)v d'origine porcine one été signalé en février 2024 en Brésil et Espagne.

Le premier cas était celui d'un homme de 49 ans atteint de troubles sous-jacents à Toledo, Paraná, au Brésil. Le cas a présenté des symptômes de fièvre, de maux de tête, de toux, d'adynamie, d'odynophagie, de dyspnée et d'asthénie le 12 décembre 2023 ; il a été hospitalisé le 16 décembre 2023 et a reçu son congé après s'être complètement rétabli le 18 décembre 2023. Le cas n'a pas reçu de traitement antiviral ni le vaccin contre la grippe saisonnière en 2023 et n'a pas d'antécédents d'exposition aux porcs. Aucun contact étroit du cas n'a été identifié. Le 15 janvier 2024, les résultats ont confirmé une infection à A (H1N1) v. Selon les résultats du séquençage, rapportés par l'OMS « le virus présente une similarité de 99 % avec le virus A/Paraná/20675/2022 (A/H1N1 pdm09) précédemment détecté dans la ville de Toledo, Paraná en octobre 2022. Les segments PB2, PB1, PA, NA et MP correspondaient au virus A/Paraná/10835/2021 (A/H1N1 pdm09) également signalé dans la ville de Toledo et les segments NP et NS correspondaient au virus A/Paraná/44706/2022 (A/H3N2v) signalé dans la ville de Santa Helena, également dans l'état du Paraná. Un deuxième résultat HA, cependant, a montré une similarité de 95 % avec les virus collectés sur le porc brésilien en mars 2015 (A/swine/Brazil/EMBRAPA-35152/2015) ».

Le deuxième cas était celui d'un ouvrier d'élevage de porcs de 33 ans de Catalogne, à Lleida, en Espagne, qui n'avait aucun problème de santé sous-jacent. Le cas a développé des symptômes de toux avec expectoration muco-purulente, fièvre, malaise et myalgie le 25 novembre 2023 et a été diagnostiqué avec une bronchite. Le cas a été traité avec des bronchodilatateurs et des corticostéroïdes oraux, mais n'a pas reçu de traitement antiviral. Le 14 décembre 2023, les résultats ont confirmé une infection à A (H1N1) v cataloguée A/Catalonia/NSAV198289092/2023 (accès à GISAID : EPI_ISL_18782577). Un échantillon a été envoyé pour confirmation à l'Institut national de microbiologie et l'isolat de virus sera communiqué au Centre collaborateur de l'OMS ; les résultats ne sont pas encore disponibles. Le cas s'est rétabli depuis. À ce jour, l'enquête épidémiologique n'a révélé aucun nouveau cas chez des contacts étroits ou des collègues de travail à la ferme. 

En 2024, deux cas humains de grippe A (H1N1) v d'origine porcine ont été détectés dans le monde. Cinq cas humains de grippe A(H1N1)v ont été signalés dans le monde en 2023 au Brésil (1), en Chine (2), en Espagne (1) et en Suisse (1). Au total, 46 cas humains de grippe A(H1N1)v d'origine porcine ont été signalés à l'échelle mondiale depuis 2005, avec un taux de létalité de 2 %. Deux détections de grippe A(H1N1)v d'origine porcine ont été signalés chez des résidents canadiens depuis le début du signalement en 2005, le premier cas ayant été signalé en Ontario en septembre 2012 et le deuxième au Manitoba en avril 2021 (voir le bulletin APRE no 52).

Grippe A(H1N2)v d'origine porcine

Le cas humain le plus récent de grippe A(H1N2)v d'origine porcine a été signalé en novembre 2023 au Royaume-Uni.

À ce jour, aucun cas humain de grippe A(H1N2)v d'origine porcine n'a été signalé dans le monde en 2024. Quatre cas humains de grippe A(H1N2)v d'origine porcine ont été signales dans le monde en 2023 aux États-Unis (2), au Royaume-Uni (1) et à Taiwan (1). Au total, 50 cas humains de grippe A(H1N2)v d'origine porcine ont été signalés à l'échelle mondiale depuis 2005, avec un taux de létalité de 0 %. Trois détections de grippe A(H1N2)v d'origine porcine ont été signalées chez les résidents canadiens depuis le début de la déclaration en 2005. Le premier cas a été signalé en Alberta en octobre 2020 (voir le bulletin APRE no 46), le deuxième au Manitoba en avril 2021 (voir le bulletin APRE no 52) et le dernier cas sur le territoire canadien a été signalé au Manitoba en novembre 2021 (voir le bulletin APRE no 59).

Grippe A(H3N2/H3NX)v d'origine porcine

Le cas humain de grippe A(H3N2)v d'origine porcine le plus récent a été signalé en novembre 2022 aux États-Unis. Le cas humain le plus récent de grippe A(H3NX)v d'origine porcine a été signalé en août 2023 aux États-Unis.

À ce jour, aucun cas humain de grippe A(H3N2)v d'origine porcine n'a été signalé dans le monde en 2024. Si l'on exclut le cas déclaré de A (H3NX) v aux États-Unis (1), aucun cas de grippe A (H3N2) v d'origine porcine n'a été détecté en 2023. À l'exclusion de ce cas, 446 cas de grippe A(H3N2)v d'origine porcine ont été signalés à l'échelle mondiale depuis 2005, avec un taux de létalité de <1 %. Deux détections de grippe A(H3N2)v d'origine porcine ont été signalés chez des résidents canadiens depuis le début de la déclaration en 2005, le dernier cas ayant été signalé en juin 2021 (voir le bulletin APRE no 54).

Mise à jour sur le Coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (SRMO-CoV)

Un nouveau cas humain et des détails sur trois cas de SRMO-CoV signalés précédemment ont été reportés en février 2024 par l'Arabie saoudite.

Le premier cas était une femme saoudienne âgée de 59 ans, travailleuse non soignante (femme au foyer), dans la région de l'Est. Elle a eu de la fièvre, de la toux, des maux de gorge et de l'essoufflement le 30 septembre 2023. Elle a été admise à l'hôpital le 5 octobre 2023 et a reçu un diagnostic de pneumonie. Elle a été libérée le 12 novembre 2023. Elle souffrait de multiples comorbidités : diabète, asthme et leucémie. Elle n'avait pas d'antécédents clairs d'exposition à des facteurs de risque connus. Un suivi a été effectué pour 16 contacts familiaux et 29 travailleurs de la santé, et aucun cas secondaire n'a été identifié.

Le deuxième cas est celui d'une femme saoudienne âgée de 93 ans, non-travailleuse de la santé, qui vit dans la région de Qassim. Elle a eu de la fièvre, un mal de gorge, de la confusion et une perte de connaissance le 15 septembre 2023. Elle a été admise à l'hôpital de Qaseem le 23 septembre 2023 et a été référée à un hôpital de Riyad le 25 septembre 2023 pour le traitement de ses problèmes de santé chroniques. On lui a diagnostiqué une pneumonie. Elle a été admise à l'unité de soins intensifs dans un état critique le 25 septembre 2023. Elle est décédée le 19 octobre 2023. Elle avait des antécédents de diabète et de maladie du foie. Elle n'avait pas d'antécédents clairs d'exposition à des facteurs de risque connus. Un suivi a été effectué pour cinq contacts familiaux et 43 travailleurs de la santé, et aucun cas secondaire n'a été identifié.

Le troisième cas était celui d'un homme de 79 ans, ressortissant saoudien, non travailleur de la santé dans la région de Riyad. Il a eu de la fièvre, de la toux et de l'essoufflement le 27 septembre 2023. Il a été hospitalisé et admis aux soins intensifs le 29 septembre 2023, et on lui a diagnostiqué une pneumonie. Le cas a reçu son congé de l'hôpital le 12 novembre 2023. Ses comorbidités comprenaient le diabète et la maladie pulmonaire obstructive chronique. Il n'a pas eu de contact direct avec des chameaux, mais il a eu des contacts avec son frère, qui est propriétaire de chameaux. Le frère du cas était asymptomatique et a obtenu un résultat négatif au test SRMO-CoV (toutefois, ce test a été effectué plus de 10 jours après la confirmation du cas positif). Au total, un suivi de 5 contacts familiaux et de 14 travailleurs de la santé a été effectué, et aucun cas secondaire n'a été identifié. Les chameaux du frère du cas étaient asymptomatiques et aucun résultat de laboratoire n'a été communiqué.

Le quatrième cas était celui d'un ressortissant saoudien de 66 ans, non-travailleur de la santé vivant dans la région de Riyad. Il a eu de la fièvre, de la toux et de l'essoufflement le 26 octobre 2023. Le cas a été admis à l'unité de soins intensifs de Riyad le 8 novembre 2023, et on lui a diagnostiqué une pneumonie. Il est décédé le 24 décembre 2023. L'asthme était considéré comme une comorbidité. Il avait des antécédents de contact direct avec des chameaux, car il en était propriétaire. Au total, un suivi de 16 contacts familiaux et de 34 travailleurs de la santé a été effectué, et aucun cas secondaire n'a été identifié. Les chameaux étaient asymptomatiques et aucun résultat de laboratoire n'a été communiqué.

À ce jour, un nouveau cas humain de SRMO-CoV et un nouveau décès ont été signalés en 2024. En 2023, 10 cas de SRMO-CoV ont été signalés à Oman (1), en Arabie saoudite (8) et aux Émirats arabes unis (1). Un total de 2 609 cas de SRMO-CoV confirmés en laboratoire, dont 939 décès, ont été signalés dans le monde depuis 2012 par l'OMS (TL : 36 %) (Figure 5). Aucun cas n'a été signalé au Canada.

Figure 5 - Équivalent textuel

Répartition temporelle des cas humains de SRMO-CoV déclarés par l’OMS à l’échelle mondiale, par mois et par année, du 1er janvier 2019 au 29 février 2024 (n=330).

		Décès	Survivants
2019	Janv	5	14
	Févr	14	62
	Mars	3	26
	Avr	11	11
	Mai	4	10
	Juin	1	6
	Juillet	4	5
	Août	1	5
	Sept	1	3
	Oct	6	8
	Nov	2	10
	Déc	3	2
2020	Janv	5	15
	Févr	5	14
	Mars	5	10
	Avr	0	2
	Mai	5	2
	Juin	0	0
	Juillet	0	0
	Août	0	0
	Sept	0	0
	Oct	0	0
	Nov	1	3
	Déc	0	3
2021	Janv	0	0
	Févr	3	3
	Mars	1	1
	Avr	0	0
	Mai	1	0
	Juin	0	1
	Juillet	0	2
	Août	1	0
	Sept	0	0
	Oct	0	1
	Nov	0	0
	Déc	3	0
2022	Janv	0	0
	Févr	0	0
	Mars	0	1
	Avr	1	0
	Mai	2	2
	Juin	0	0
	Juillet	0	0
	Août	0	0
	Sept	0	0
	Oct	0	0
	Nov	41	4
	Déc	0	1
2023	Janv	0	2
	Févr	0	0
	Mars	1	1
	Apr	0	0
	Mai	0	0
	Juin	0	0
	Juillet	0	1
	Août	2	1
	Sept	0	0
	Oct	0	0
	Nov	1	2
	Déc	0	0
2024	Janv	0	0
	Févr	1	0